PhD Aorta Plan Predictions of postoperative outcome of vascular patients with AI

Intro

Gedrevenheid, nieuwsgierigheid en passie voor onderzoek in vaatchirurgie.

Wat ga je doen?

• Ontwikkelen en implementeren van machine learning-algoritmen om medische gegevens uit verschillende bronnen (afbeeldingen, scans, klinische gegevens, wearables en omics enz.) te analyseren met als doel het voorspellen van de progressie van de dynamiek van aorta-aneurysma's na EVAR en aortadissecties.
• Integreren van de ontwikkelde AI-modellen tot een gebruiksvriendelijk platform voor klinisch gebruik door zorgprofessionals (digital twin platform).
• Prospectieve gegevensverzameling met wearables en coördinatie van het onderzoek (gesprekken met patiënten en artsen).
• Samenwerken met zowel lokale als internationale partners (inclusief klinische, experimentele en computationele partners) om de volledigheid en toepasbaarheid van het onderzoek te behouden. Dit omvat de andere promovendus die werkt aan omics/deelnemen aan het verzamelen en annoteren van medische gegevens voor training en validatie van AI-modellen.
• Presenteren van onderzoeksresultaten op wetenschappelijke conferenties en workshops.

Wat neem je mee?

• Je hebt een MSc in Technische Geneeskunde, Computational Science, Computer Science, Computational Physics, Toegepaste Wiskunde, Biomedische Technologie of een gerelateerd vakgebied, en hebt een sterke affiniteit met biogeneeskunde. Je hebt een grote interesse in medisch onderzoek, zowel in basiskennis van de fysiologie via simulatie als in toepassingen in een klinische setting.
• Je hebt ervaring met Python en C++ en met software engineering tools en bent bekend met versiebeheer (git). Indien nodig ben je enthousiast en bereid om nieuwe vaardigheden te leren op het gebied van computationele vloeistofdynamica, numerieke methoden of programmeren. Bekendheid met een van de volgende zaken wordt als een voordeel beschouwd: GPU-programmering, numerieke algoritmen, high-performance computing, medische beeldsegmentatie.
• Je hebt een professionele beheersing van het Engels in woord en geschrift (een opleiding in academische vaardigheden is een pré).

Wat bieden we jou?

• Een vliegende start van je carrière in het wetenschappelijk onderzoek.
• Veel ruimte voor persoonlijke ontwikkeling met een breed aanbod aan opleidingen en ontwikkeling van academische vaardigheden.
• Werken aan grootschalig en eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s.
• Een tijdelijk PhD-contract van 12 maanden dat na positieve evaluatie in het eerste jaar wordt verlengd voor de duur van het project (4 jaar).
• Inschaling in salarisschaal OIO: € 3.017 tot € 3.824 bruto per maand bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%. Bereken hier jouw netto salaris.
• Vakantie-uren: 186,4 per jaar en mogelijkheid om extra uren te sparen.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen. Uitstekende bereikbaarheid met het openbaar vervoer en vergoeding van een groot deel van uw reiskosten.

Waar ga je werken?

Associate Prof. Dr. Kak Khee Yeung is de projectleider en zal tevens je begeleider zijn. De andere toezichthouder is As. Prof. dr. Jelmer Wolterink van de Universiteit Twente. De onderzoeksgroep translationele vaatchirurgie biedt een vindingrijke en stimulerende wetenschappelijke omgeving. De andere vaatchirurgen die betrokken zijn bij het VASCUL-AID project zijn Prof. Dr. Ron Balm, prof. dr. Jan Blankensteijn, dr. Vincent Jongkind en technisch arts Stefan Smorenburg. Je komt terecht in een vindingrijke en stimulerende wetenschappelijke omgeving. Wij zijn een energiek en enthousiast team van ongeveer 16-20 promovendi en twee postdocs.

In Amsterdam UMC zien we jaarlijks ruim 300 aorta-aneurysma’s en ruim 500 PAD-patiënten. Daarnaast zijn wij uitgerust met een hybride endovasculaire operatiekamer.

Wat ga je onderzoeken?

Patiënten ouder dan 65 jaar met een aorta-aneurysma (AA) of aortadissectie (AD) hebben vaak comorbiditeiten, waardoor de chirurgische risico's toenemen. Nauwkeurige informatie over de risico's en voordelen van de behandeling is van cruciaal belang. Het Aorta PLAN-project maakt gebruik van AI om gepersonaliseerde, op bewijs gebaseerde voorspellingen te doen voor de resultaten na endovasculaire behandeling (EVAR) voor abdominale AA- en type B-dissecties. Twee promovendi gaan zich hierop richten, één met behulp van geavanceerde beeldanalyse, klinische data en wearables.

Het project waar de promovendi aan zullen werken heet Gepersonaliseerde therapie voor patiënten met aortaziekte (Aorta PLAN). De afdeling Vaatchirurgie van Amsterdam UMC (locatie AMC) werft momenteel een promovendus om in ons laboratorium vierjarig te promoveren voor ons project Aorta-PLAN.

Doelstellingen van het onderzoek zijn:

• De beeldanalyse bevorderen met AI door geometrische en hemodynamische AAA-parameters te bestuderen met behulp van anatomische medische beelden om de progressie van AAA te voorspellen en belangrijke anatomische kenmerken te identificeren die zakkrimp, zakstabilisatie of zakgroei na EVAR voorspellen.
• Het identificeren van voorspellende parameters van de progressie van aortadissectie door geavanceerde beeldanalyse, omics (aangeleverd door de andere promovendus) en klinische gegevens te bestuderen.
• Het opzetten van een digitale tweeling voor AAA-behandeling en AD-behandeling (voorspellingsmodel) en deze visualiseren door een digitale atlas te ontwikkelen om de communicatie tussen patiënten en artsen te verbeteren.

In je onderzoek werk je nauw samen met een andere promovendus die zich gaat bezighouden met prognostisch experimenteel onderzoek en met een aantal onderzoekers die werken aan het VASCUL-AID project.

 

Als je denkt dat het profiel bij je past en je bent geïnteresseerd in de functie, dan zien wij je sollicitatie graag tegemoet. Aanvragen worden tijdens de publicatieperiode doorlopend verwerkt. Bij voldoende kandidaten kan de vacature tussentijds worden gesloten. In augustus en september staat de eerste ronde sollicitatiegesprekken gepland. Wij vragen jou hiermee rekening te houden in jouw agenda indien jij wordt uitgenodigd voor een gesprek.

Let op: Wegens de vakantieperiode zal jij pas na 12 augustus een reactie krijgen op jouw sollicitatie.

Let op: Sollicitaties moeten de volgende informatie bevatten (alle bestanden, behalve uw CV, moeten in één pdf-bestand worden ingediend):

• een gedetailleerd CV inclusief de maanden (niet alleen jaren) waarin wordt verwezen naar je opleiding en werkervaring;
• een motivatiebrief (max. 1 pagina); een digitale kopie van je masterproef;
• een volledig overzicht van bachelor- en mastervakken (inclusief cijferlijsten en uitleg over het beoordelingssysteem dat door uw universiteit wordt gebruikt);
• de namen en e-mailadressen van twee referenties die aanbevelingsbrieven kunnen verstrekken.

Als je vragen hebt over deze functie, neem dan gerust contact op met de projectbegeleider Kak Khee Yeung, via onze secretaresse Laura van Wieringen via l.wieringen@amsterdamumc.nl. Zorg ervoor dat je in de onderwerpregel "Vacature PhD AI Aorta PLAN" vermeldt.

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je contact opnemen met Rhiannon Sandfort, Recruitmentadviseur, via r.e.sandfort@amsterdamumc.nl.

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Lees hier wat dit inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is.

Interne kandidaten krijgen voorrang op externe kandidaten als zij even geschikt zijn.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.